微卫星 数据分析数据分析,谁有microsatellite toolkit,求助求助

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勐养保护区亚洲象微卫星位点筛选及种群遗传多样性分析
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【求助】高手帮我看一下微卫星电泳峰图(很急,谢谢!)
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这个帖子发布于10年零42天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
我做的材料很多文献上说是单倍体,而且他们做的结果基本符合单倍体的情况(大多数只出一条带),但是我做的时候却不太一样,多数情况出了两条带,虽然可能出现两条带的情况(因为在生殖期时是二倍体),但按照几率来说,也是很小的。所以我向大家求助,来帮我分析一下,我以前在园子里看到有人对峰图分析很在行,希望能帮一下小弟,马上就要答辩了,千万不要延期才好。谢谢!补充:重复类型为二碱基重复
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花菱烈火 edited on
求高手帮忙啊,自己先顶一下!
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丁香园准中级站友
你做的是自己合成的引物吗片断长度多少应该是杂合子不过你第1、2 2各产物浓度太低了纵坐标只有100多不能排除是假阳性,其他的如果不是由于引物问题的非特异性扩增或是污染绝对是杂合子
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谢谢指导~
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yes,absolute heterozygote!!
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【求助】求助分析微卫星突变和无效等位基因的软件
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这个帖子发布于7年零341天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
我已经做了父母和子代的一百多个microsatellite的genotyping,我现在想分析一下这些微卫星中有多少个微卫星有突变和无效等位基因(有人也叫哑等位基因,即不能扩增出的等位基因),肉眼看太花时间,也太麻烦。请问各路高手,有什么软件可以用来分析一下是否有突变和无效等位基因?谢谢指点!
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兽类学报,;2):126-134ActaTheriologicaSinica。勐养保护区亚洲象微卫星位点筛选。及种群遗传多样性分析。(2LaboratoryofGenomicDiversity,NationalCancerInstitute,Frederick,MD-1201,USA)(1教育部生物多样性与生态工程重点实验室,北京师范大学生态研究所,北京)蔡清秀 林柳 潘文婧 罗述金 张立?。摘要:本文以亚洲象肌肉样品提出的DNA为模板,从非洲象31个微卫星位点和5个已知亚洲象微卫..
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