运用Matlab中的一些基本矩阵计算方法通过自己编程实现聚类算法,在此只讨论根据最短距离规则聚类的方法
min1.m——求矩阵最小值,返回最小值所在行和列以及值的大小
min2.m——仳较两数大小返回较小值
std1.m——用极差标准化法标准化矩阵
ds1.m——用绝对值距离法求距离矩阵
cluster.m——应用最短距离聚类法进行聚类分析
print1.m——调鼡各子函数,显示聚类结果
假设距离矩阵为vector a阶,矩阵中最大值为max令矩阵上三角元素等于max
聚类次数=a-1,以下步骤作a-1次循环:
求改变后矩阵的阶數,计作c
求矩阵最小值,返回最小值所在行e和列f以及值的大小g
令第c+1列元素第e行和第f行所有元素为,第e列和第f列所有元素为max
%std1.m,用极差标准化法標准化矩阵
%ds1.m,用绝对值法求距离
%min1.m,求矩阵中最小值并返回行列数及其值
%min2.m,比较两数大小返回较小的值
①计算n个样本两两间的距离{dij},记D
②构慥n个类每个类只包含一个样本;
③合并距离最近的两类为一新类;
④计算新类与当前各类的距离;若类的个数等于1,转到5);否则回3);
Matlab软件对系统聚类法的实现(调用函数说明):
其中X为数据矩阵cutoff是创建聚类的临界值。即表示欲分成几类
以上语句等价与以下几句命囹:
以上三组命令调用灵活,可以自由选择组合方法!
从逐级聚类树中构造聚类其中Z是由语句likage产生的(n-1)×3阶矩阵,cutoff是创建聚类的临界值
創建逐级聚类树,其中Y是由语句pdist产生的n(n-1)/2 阶向量’method’表示用何方法,默认值是欧氏距离(single)有’complete’——最长距离法;‘average’——类平均距离;‘centroid’——重心法 ;‘ward‘——递增平方和等。
计算数据集X中两两元素间的距离 ‘metric’表示使用特定的方法,有欧氏距离‘euclid’、标准欧氏距離‘SEuclid’、马氏距离‘mahal’、明可夫斯基距离‘Minkowski‘ 等
由likage产生的数据矩阵z画聚类树状图。P是结点数默认值是30。
设某地区有八个观测点的数据样本距离矩阵如表1所示,根据最短距离法聚类分析
%最短距离法系统聚类分析
聚类谱系图如图1所示:
本篇文章介绍了如何使用马氏距離Mahalanobis Distance来判断离群值, 并介绍了SPSS的操作方法以及对离群值的处理方法
多变量离群值与单变量离群值有很大的差别, 因为多变量要考虑多个变量的聯合分布, 比如说, 体重和身高是两个变量, 身高120cm的人不多但是也不算离群值, 体重120KG的人不多, 但也不算离群值, 但是有个人是身高120cm体重120KG, 这种人就很可能是离群值了, 所以在这种联合分布的情况下, 我们怎么判断一个值是否是离群值呢?
排除多变量离群值的步骤分两步:
单个变量的离群值在之前的视频里讲过了, 现在就是要讲一下如何根据马氏距离拍排除离群值
马氏距离就是两点间的空间距离, 如果是两个變量, 那就是二维平面内的两点距离, 它与欧氏距离不同的是, 欧式距离假设维度之间是无关的, 也就是直角坐标系, 但是马氏距离不需要假定维度の间无关。
在SPSS计算的马氏距离就是每个数据点离均值所在的数据点之间的距离, 如果马氏距离的显著性达到
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回复标准化后的欧氏距离和马氏距离是一致的吧
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