简单介绍蛋白质水解的中间产物方法及各法的优缺点

蛋白质分离器_百度百科
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蛋白质分离器(Protein skimmer)又称为蛋分,蛋分器,化蛋,化氮器,蛋白质除沫器,蛋白质分馏器,泡沫分馏器。它是利用水中的气泡表面 可以吸附混杂在水中的各种颗粒状的污垢以及可溶性的有机物的原理,采用充氧设备或旋涡泵产生大量的气泡,将通过蛋白质分离器将海水净化,这些气泡全部集中在水面形成泡沫,将泡沫收集在水面上的容器中,它就会变为黄色的液体被排除。
蛋白质分离器的工作原理很简单,但能很有效的利用气泡的表面张力来分离水中的蛋白质,蛋白质分离器有三种:逆流式、压力式和气举式(已基本淘汰)。理论上蛋白质分离器能分离水中80%的蛋白质,但她的实际工作能力只能分离水中30——50%的蛋白质废物,能达到50%已经是很不错了。
图片来源:四海浩洋
蛋白质分离器的接触表面,类似于空气和水之间的表面。举例来说,水族箱的水表面所形成的接触表面,有一定的表面张力,所以纤维素、蛋白素和食物残渣必然会在此堆积。事实上,如果扩大表面区域,例如产生气泡(制造泡沫),则会有更多的纤维素、蛋白素和食物残渣在表面自然地形成。泡沫的粘度将随着表面的增强和扩大,以及气泡的逐渐消失而改变。因此,蛋白质分离器的有效性就在于扩大气体和液体之间的表面区域以及其特定的表面张力。然而,所产生的泡沫与水族箱中水循环的排放是分离的,这也就是为何泡沫可直接由水族箱中清除废物的方法。蛋白质分离器的优点:
1、它不是过滤器,而是一台简单的机器;
2、它能在有机物分解成有毒废物前将她分离,减轻了生化系统的负担;
3、增加水中的溶氧量。
蛋白质分离器的缺点:
1、会氧化水中的微量元素,如铁、钼、锰等重要的微量元素;
2、会造成盐分的丧失;
3、海水被雾化后会无孔不入,且腐蚀性很强;
4、在增氧的同时会排出CO2——珊瑚必须的。
虽然蛋白质分离器有许多优点,但它最多只能清除水循环中80%的有机新陈代谢产物。为了达到更佳的效果,蛋白质分离器必须同时配合使用臭氧机。
水中也含有一些蛋白质分离器所不能分解的物质,包括血浆蛋白之类的蛋白质,以及氨基酸中蛋白素的某些成分。通常蛋白质分离器只能清除30%到50%的物质。若要蛋白质分离器愈活跃,它所需要的动力就愈多。
有了动力的输入及表面的扩大,除了蛋白素的结合之外,还可产生其他的作用。首先,一个非常有利的因素,就是大量的氧气会注入水中,这些氧气可以促进细菌分解残渣。但是,这项作用也会除去水族箱中的二氧化碳,也会因为碳酸盐硬度下降,并使得pH值升高。由于不同气体,也就是二氧化碳和氧气的密集交换,使得反应接触点部分的氧气含量极高,因而导致铁、钼和锰之类的主要微量元素在水面之外被氧化掉。此外,对于单细胞虫黄藻的影响也十分重大,其用来保存微量元素的凝胶,会因为这种反应而解体。而蛋白质分离器所排放的净水充满了丰富的氧气,只含有少量的二氧化碳、微量元素和维生素,所以在使用蛋白质分离器,必须适当地添加这些物质。然而,这也可能会产生特殊的困难,尤其当蛋白质分离器必须额外地依靠臭氧来工作时,则上述反应都会更加增强。蛋白质分离器的原理图如下:
图片来源:四海浩洋图片来源产品型号与规格参数
处理量(T/H)
进出水口(mm)
泡沫排污口(mm)
Ф450×1650
Ф600×1700
Ф50/Ф110
Ф650×2100
Ф63/Ф110
Ф750×2100
Ф63/Ф140
Ф850×2600
Ф75/Ф140
Ф850×2450
Ф75/Ф160
Ф950×2600
Ф90/Ф160
ZH-NPS-100
Ф950×3050
Ф110/Ф200
ZH-NPS-120
Ф110/Ф200
ZH-NPS-150
Ф160/Ф250
ZH-NPS-200
Ф200/Ф250
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352011 iTRAQ技术及其在蛋白质组学中的应用
ISSN;CN11-3870/Q;中国生物化学与分子生物学报http://cjbm;ChineseJournalofBiochemi;2011年7月;27(7):616~621;?综述?;iTRAQ技术及其在蛋白质组学中的应用;1)2)1)3)2)2)*;谢秀枝,王欣,刘丽华,董世雷,皮雄娥,刘伟(;1);内蒙古工业大学化工学院,呼和浩特;
ISSNCN11-3870/Q中国生物化学与分子生物学报http://cjbmb.bjmu.edu.cnChineseJournalofBiochemistryandMolecularBiology2011年7月27(7):616~621?综述?iTRAQ技术及其在蛋白质组学中的应用1)2)1)3)2)2)*谢秀枝,王欣,刘丽华,董世雷,皮雄娥,刘伟(1)内蒙古工业大学化工学院,呼和浩特3)010051;2)浙江省农业科学院植物保护与微生物研究所,杭州321004)310021;浙江省师范大学化学与生命学院,金华摘要近年来随着蛋白质组学的迅速发展,其相应的方法学研究也取得了巨大的进步,一系列新技术极大地促进了这门学科的发展.相对和绝对定量同位素标记(iTRAQ)技术融入了蛋白质组学研究中,与高度敏感性和准确性的串联质谱及多维液相色谱联用技术已成为蛋白质定性和定量研究的主要工具之一.该技术可对复杂样本、细胞器、细胞裂解液等样本进行相对和绝对定量研究,具有较好的定量效果、较高的重复性.由于其能够同时对多达8种样品进行标记分析,故在生命科学的各个领域得实验流程、优缺点及近几年的应用进展进行综述.到了广泛的应用.本文对iTRAQ的原理、关键词物标记物中图分类号Q51相对和绝对定量同位素标记(iTRAQ)技术;蛋白质组学;串联质谱;多维液相色谱;生ITRAQTechnologyandItsApplicationinProteomicsXIEXiu-Zhi(2)1)1),WANGXin2),LIULi-Hua1),DONGShi-Lei3),PIXiong-E2),LIUWei2)*SchoolofChemicalEngineering,InnerMongoliaUniversityofTechnology,Hohhot010051,China;InstituteofPlantProtectionandMicrobiology,ZhejiangAcademyofAgriculturalSciences,Hangzhou310021,China;3)SchoolofChemistryandLifeScience,ZhejiangNormalUniversity,Jinhua321004,China)AbstractInthepastyears,proteomicswasdevelopedquicklyanditscorrespondingmethodologicalresearchhasalsobeenmadegreatprogress,aseriesofnewtechnologiesblendedinproteomicstechnology,particularlythenewcombinationofmulti-dimensionalliquidchromatographyandmassspectrometry(MS)-basedtechnologieswithproteinfragmentationmethods,enableuseasilytoidentifythedynamicsofproteinsprofilesinanycomplexbiologicalprocess.Isobarictagsforrelativeandabsolutequantification(iTRAQ)isoneofthenewtechniqueswithhighsensitivityandaccuracy,demonstratingaremarkableadvantageinsimultaneousanalysisofmultiplesamplesandsubsequentlyprovidingtherelativequantificationonhundredsofproteinsatonetime.TheiTRAQreagentproducedhighquality,reproducibleresultinenrichedcomplexes,organelles,andwholecelllysates.HenceiTRAQhasbeenwidelyusedinareasoflifescience.Thisreviewwillfocusontheprinciple,experimentalprocedureandapplicationofiTRAQinthelastfewyears.Keywordsisobarictagsforrelativeandabsolutequantification(iTRAQ);proteomics;tandemmassspectrometry;multi-dimensionalliquidchromatography;biomarker人类基因组计划的顺利完成,使生命科学研究的重心转到了生物功能的整体研究上.但由于基因组学自身的局限性,它无法回答诸如蛋白质的表达时间、表达水平、翻译后修饰以及蛋白质与蛋白质或与其它生物分子的相互作用等问题.自1994年澳大利业科学家Wilkins和Williams等第一次提出蛋白质组学的概念以来[1]03-15;接受日期:收稿日期:2011-国际科技合作项目(No.2008DFA32080)*;E-mail:biolwei@sina.com联系人Tel:0571-Received:March15,2011;Accepted:May13,2011SupportedbytheInternationalTechnologyCooperationProjects(No.2008DFA32080)*,蛋白质组学已经在生命科学CorrespondingauthorTel:6;及医学的各个研究领域蓬勃发展.过去,许多科学家E-mail:biolwei@sina.com第7期谢秀枝等:iTRAQ技术及其在蛋白质组学中的应用617都致力于蛋白质组的大规模定性分析,而如何系统地识别和定量一个蛋白质组则是如今蛋白质组学研究的一个主要目的,因为蛋白质浓度对于其功能的实现有着非常重要的作用.一种特殊蛋白质在浓度就能预示细胞的突变过程.同时,许多蛋上的变化,白质生物标记物也是以含量丰度的变化来显示生物体内某种功能的实现或者疾病的发生.因此,对蛋白质的相对和绝对浓度进行测量就变得非常重要.近有关高通量蛋白质组学的仪器、试剂、技术的年来,大力发展使得同时识别和比较疾病发生,以及与疾病治疗相关的蛋白表达水平变化成为可能[2]素试剂来同时标记和比较8种(或4种)不同的蛋白质样品.以8种不同的同位素试剂为例,这些试剂(Fig.1)由3个不同的化学标签组成:标签分子分别114、115、116、117、118、119和121的由质量为113、191、190、质量为192、报道基团(reportergroup),189、188、187、186和184的平衡基团(balancegroup)和1个相同的反应基团(reactivegroup)组成.肽反应基团将iTRAQ标签与肽段的N-端基团可标记所有酶解肽段,在其和每个赖氨酸侧链相连,上8种报告基团通过平衡基团与反应基团相连.报告基团和平衡基团的平衡分子量都为305,因此改变任一iTRAQ试剂,不同同位素在标记同一多肽后在第一级质谱检测,分子量都完全相同.而在串联质谱中,同重元素标记肽段自Fig.1所示虚线部分裂平衡基团在二级质谱发生中性丢失.信号离子表解,因此,根据波峰现为不同质荷比(113~121)的峰,的高度及面积,可以得到蛋白质的定量信息.iTRAQ技术的大体流程如Fig.2所示.样品一般先经胰蛋白酶裂解、烷基化、酶解为肽段,所产生再将的肽段用iTRAQ试剂多重标签进行差异标记,[5]标记样本相混合,最后用LC-MS/MS进行分析..相对和绝对定量同位素标记(isobarictagsforrelativeandabsolutequantitation,iTRAQ)技术是美国应用生物系统公司在2004年推出的一项新的体外同位素标记技术[3].使用该技术可以寻找差异表达蛋白,并同时可以对1个基因组表达的全分析其蛋白功能,部蛋白质或1个复杂的混合体系中的所有蛋白质进iTRAQ技术已经在蛋白质行精确定量和鉴定.如今,组学的定量研究中得到了极其广泛的应用.1iTRAQ技术的原理及其操作流程iTRAQ技术使用8种[4](或4种)不同的同位每一个iTRAQ实验都会产生成千上万个光谱,数千Fig.1Eight-plexreagentstructureTheiTRAQreagentwasdesignedasanisobarictagconsistingofachargedreportergroup,apeptidereactivegroup,andaneutralbalanceportiontomaintainanoverallmassof305.Theseuniquereagents,uponMS/MSfragmentationgiverisetoeightuniquereporterions(m/z=113~121besides120)thatareusedtoquantifytheirrespectivesamples.TheiTRAQreagentslabellysineresiduesandtheN-terminiofpeptides,and100%sequencecoverageispossiblewithappropriatedigestionconditions个可识别多肽和上百个可鉴定蛋白.因此,生物信息学的工具和分析方法对于分析和解释这些数据是必不可少的.许多新近开发的数据管理和分析工具可Protein以用来分析这些庞大的数据.如ProQuant、Pilot等由iTRAQ试剂制造商提供的软件及其它大量免费软件[6].2iTRAQ技术的优缺点目前,蛋白质组学研究中应用的比较成熟的定量方法主要有两种.一种基于传统双向凝胶电泳及另一种基于质谱检测技术.目前,应用比较广染色,泛的双向电泳技术主要是双向荧光差异凝胶电泳618中国生物化学与分子生物学报第27卷Fig.2ExperimentalprocessofiTRAQtechnologyGeneralschemeofamultiplexreactionofeightdifferentsamples(S1-S8),designatedbyeightdifferentcolours.Eachindividualsampleisreduced,alkylatedandenzymaticallydigestedwithtrypsin.Theresultingpeptidepool(s)arethenlabeledwiththemultiplextags,respectively,inaparallelsetofreactionsandcombinedandsubsequentlyanalyzedbyLC-MS/MS(two-dimensionalfluorescencedifferencegeliTRAQ标记目对组织来源的蛋白质进行分析;第三,大大降低了实验过前可使8个样本同时相对量化,程中所引入的技术误差,而ICAT标记只限于2个SILAC至今只有3个被使用.本文对目前已样本,有的同位素标记技术进行了比较,其结果如Table1所示.非标记定量法是最近才提出的应用于定量蛋白质组学研究的新方法.它包括基于色谱峰面积定量法及利用二级离子信号的强度进行的MRM(多反应监测)检测等.非标记定量法不需要同位素标签做具有经济、高通量和省时省力等优点.然内部标准,而,这种技术比较依赖于仪器的状态、样品的复杂性以及一些未知因素.由于目前质谱技术水平的限制,非标记定量法的灵敏度和准确性都比不上标记定量法.标记定量法将离子抑制效应、背景噪音和仪器条件等系统误差的影响降到了最小.基于以上优点,iTRAQ技术已成为目前蛋白质组学定量方法中一个十分重要的技术,其作用已经在许多生物体和组织研究中得到证明[7-9]electrophoresis,2D-DIGE).但由于双向电泳本身的弊端,其对蛋白质的分离受到蛋白丰度、等电点、分子量和疏水性等的限制,对于低丰度蛋白、极大(相对分子质量>200kD)和极小蛋白(相对分子质量<8kD)、极碱性蛋白和疏水性蛋白都难以进行有效分离.因此,限制了其应用范围.而iTRAQ技术可以对任何类型的蛋白质进行鉴定.此外,双向凝胶电泳操作费时费力,难以实现和质谱的直接联用,不易自动化.基于质谱的蛋白质组学定量技术可以分为两大类:标记定量技术(labelingquantitation)和非标记定量技术(label-freequantitation).而前者则可更细分为体内标记(invivolabeling)技术和体外标记(invitrolabeling)技术.标记定量技术可通过使用代谢15标记(metaboliclabeling,N标记)、同位素编码的亲和签(isotope-codedaffinitytags,ICAT)和在培养过程中使用稳定性同位素标记的氨基酸(stableisotopelabelingofaminoacidsinculture,SILAC)等来区别两种不同样品的蛋白质,后再通过质谱进行含量比较.iTRAQ标记相比ICAT/SILAC等主要有以下优点:第一,标记发生反应,单肽来自于自由的氨群(在氨基酸N端的每个肽或在侧链上的赖氨酸),因此相对定量化;第二,作为标记的反应不在活细胞,它适合所有类型的蛋白质样品,而不像SILAC,不能,其优越性也在逐步地凸显.但iTRAQ技术本身的某些性质也制约了它的应用,比如iTRAQ试剂几乎可以与样本中的所有蛋白结合,容易受样本中的杂质蛋白及样本处理过程中缓冲液的污染,需要对样本进行预处理并尽量减少操作过程中的污染.此外,目前iTRAQ试剂仍非常昂贵,这也一定程度制约了它的广泛应用.第7期Table1谢秀枝等:iTRAQ技术及其在蛋白质组学中的应用ComparisonofseveralisotopelabelingtechniquesInvivolabelingSILACDependentofaminoacid15619MethodsMassdifferenceInvitrolabelingICATICAT:8/CyscICAT:9/CysITRAQMasstag113,114,115,116,117,118,119and121AlltypesamplesofproteinNlabelingDependentofpeptidesequenceSamplestypeMammaliancells,lowerYeast,bacteriaandorganisms(yeast,bacteria,mammalianwormsandplantcells)AlltypeofproteinsamplesLabeledseparationLabeledtargetProteinseparationtechniquesProteinseparationtechniquesPeptidesseparationsuchasSDS-PAGE,LCsuchasSDS-PAGE,LCtechniquessuchasLCProtein(optionalaminoacid)NocrossreactionProtein(N-terminalpeptide;Peptide(Cys)lysine,arginine,glutamine,asparaginesidechain)Nocrossreaction,butneedNeedingtooptimizethetoknowmassdifferenceoflabelingefficiency,maysequencesover-loadedlabeledPeptidesseparationtechniquessuchasLCPeptide(N-terminalaminoacids,lysinesidechainε-amino)AlllabeledTag-specific3iTRAQ技术在蛋白质组学中的应用iTRAQ技术自2004年开发以来,以其独特的优及含有铁硫簇蛋白相对含量也有上调.此外,大量假想蛋白质的含量也发生了显著变化.该研究为硫酸盐还原菌应激反应机制的研究奠定了基础.3.2iTRAQ技术在动植物研究中的应用Golovan等[12]利用iTRAQ技术处理了猪肝细胞对其中880种蛋白进行分析,在中的1476种蛋白,他们发现一些与能量错误识别率小于5%条件下,代谢、分解代谢、生物合成、电子传递、氧化还原酶类反应等有关的蛋白含量都大大增加了,这些蛋白在肝脏作为化学和能量工厂这一角色中都起着重要的他们还将人类、小鼠和猪的肝脏蛋白进作用.同时,发现三者80%蛋白都是一样的.另行了比较分析,外,他们还发现,动物的性别或经转基因引入1个异常的植酸酶都会对猪5%肝脏总蛋白产生影响.当使用qvalue将错误发生率(FDR)控制在0.1%以2就只有4种蛋白在性别差异上表现出不同,内时,种蛋白在品系(转基因/传统)中表现出不同.该研究有助于人们更好地了解不同动物肝脏蛋白质组的差异.同时,这一研究还可为改善猪肉品质、人类疾[13]病和异种器官移植等研究提供理论依据.Zhu等势在蛋白质组学定量研究中得到了广泛的应用.目前,它可以同时对多达8种样品进行分析,且应用范围广.下面就iTRAQ技术近几年在生命科学领域的一些应用做一简单的介绍.3.1iTRAQ技术在微生物研究中的应用Zhou等[10]将iTRAQ技术引入到抗菌肽的研究中.他们使用iTRAQ结合多维液相色谱和串联质谱研究经最小抑菌浓度下的人源中性白细联用技术,1处理后大肠杆菌的细胞变化.研究胞抗菌肽HNP-结果表明,一些参与糖酵解过程的蛋白酶含量丰度AcnB经HNP-1处降低了.相反,许多蛋白如AceE、理后含量丰度都显著提高了,而这些蛋白很有可能这些蛋白与抑制反应的补偿性应答有关.他们认为,含量丰度的增加或降低可能是由于抗菌肽的抗菌作用而引起.所以,这些蛋白可以作为筛选更具抗菌活[11]性的抗菌肽的靶蛋白.Redding等采用iTRAQ技术分析了硝酸盐胁迫对DesulfovibriovulgarisHildenborough(DvH,一种硫酸盐还原细菌)细胞蛋白质组成的影响.共有多达737种蛋白质被检测得到.这些蛋白质占DvH总蛋白22%,分布于各种功能范围.分析结果表明,在硝酸盐胁迫下,中枢代谢和硫酸盐还原途径中的蛋白质没有出现较大的变化,但硝酸盐还原代谢通路相关的蛋白含量有所增脯氨酸、甜菜碱和谷氨酸转运系统的蛋白加.其中,质含量提高,氧应激反应蛋白、大量ABC转运系统使用iTRAQ技术鉴定了芸苔属植物保卫细胞中的相对蛋白成份.他们用相对定量的方法在经脱落酸处理过的样品中和对照组中鉴定出431种蛋白质.在含量丰度相对上调的66种蛋白质中,与应激和防御有关的蛋白占大多数.38种蛋白的含量丰度下调了,其中许多都与新陈代谢和蛋白合成有关.也未曾有人报道过这些蛋白与脱落酸敏感或与气孔的开合有关.他们的研究不仅建立了一个完整的脱落酸敏620中国生物化学与分子生物学报第27卷感蛋白库,而且鉴定出几种新的蛋白,为后续研究其在植物保卫细胞中的功能奠定了基础.抗药性是目其复杂的抗药机制还前胃癌治疗的一个主要瓶颈,未被完全了解.为了阐明胃癌的分子抗药机制,Hu等[14]HSP27等,其中许多蛋白都有可能成蛋白ZFPM1、为指示经C3胞外酶处理后,细胞组成变化的候选生物标记.3.4iTRAQ技术在血浆研究中的应用血浆被认为是一个很有前景的与疾病相关的生物标记物.由于血浆浓度范围的复杂性和动态性仍是如今这一研究的主要障碍.因此,开发能够识别新的血浆生物标记物的蛋白质组学方法是很有必要[17]分别用免疫耗竭和蛋白均衡器去除高的.Ye等首先将iTRAQ技术引入了胃癌抗药性机制的研究中.他们以抗长春新碱的SGC7901/VCR细胞系和其亲本细胞系SGC7901为研究对象,使用iTRAQ结合LC-MS/MS技术进行分析,共发现820种蛋白质,其中91种蛋白在SGC7901/VCR和SGC790中表达有差异.使用Western印迹技术进一步验证了许多表达上有差异的蛋白,最终证实SGC7901/VCR中的MVP蛋白和抗药性有关.这一iTRAQ技术在识别癌症细胞蛋白表达差研究表明,异上具有很好的效果.3.3iTRAQ技术在脑神经组织研究中的应用脑脊髓炎及多发性硬化症是目前常见的脑部疾病.蛋白酶和肽酶是重要的细胞功能调节阀,蛋白酶的异常活动可能会导致一些脑部疾病的发生.Jain等[15]分度蛋白技术将血浆蛋白进行预处理,随后用8杯的iTRAQ技术进行标记,最后用强阳性离子交换树脂结合液相色谱和质谱联用技术分析.研究结果表明,两种预处理方法在识别蛋白数量上是互补的.好的色层析技术对于进一步分离经iTRAQ标记的多肽是非常重要的.两种预处理方法各自识别出320和248种不同的蛋白,其中包括大量的生物功能蛋7[18]白和动态范围在10内的蛋白.Tonack等提供了一个技术上更加详细的以iTRAQ技术为基础的量化血清蛋白中高丰度蛋白的免疫耗竭的方法.他们包括在进行对标准的iTRAQ实验方法做了改良,iTRAQ标记时将三乙胺碳酸氢钠缓冲液改为碳酸氢钠缓冲液,在检测时混合每个样本的复制标签.用这共鉴定出217种种经改良的方法检测胰腺癌样本,蛋白(5773种多肽),其错误发生率小于1%,254种蛋白测定的置信度大于95%.共获得了234种蛋白(置信度95%)血清蛋白的定量数据,其中包括组织泄漏浓度范围内出现的蛋白种类.试验结果表明,iTRAQ技术在检测组织泄漏范围内的蛋白具有很高的敏感性.使用iTRAQ技术研究了经鸟枪法处理后的无来比较正常胰蛋白酶和部分含有胰蛋白酶的多肽,的和实验性自身免疫性脑脊髓炎鼠腰部脊髓的蛋白酶组成变化.他们发现了许多蛋白质如:α1-巨球蛋α1B-糖蛋白、β2-微球蛋白、白(一种蛋白酶抑制剂)、染色光多肽、硫化糖蛋白1等.这些蛋白经iTRAQ试剂处理后,其含量在两种细胞中发生了变化.这表明,这些蛋白可能作为蛋白水解物的标志物,这些水解产物是由自身免疫性脑脊髓炎中改变的蛋白酶所催化水解的.经随后的Western印迹实验证实,在实验性自身免疫性脑脊髓炎组织中,的确存在特殊的蛋白质的分裂调节异常.另1个蛋白水解变化发生在α2-巨球蛋白.同时,他们还发现了另1个与α1-巨球蛋白类似的蛋白酶抑制剂.这一研究结果表明,在动物体内正常的神经元水解蛋白过程和实验性自身免疫性脑脊髓炎内源性的蛋白水解调节是不同的.这些研究结果可能作为以蛋白酶抑制剂为基础的治疗多发性硬化症的基本原理.Muetzelburg等[16]4展望随着人类基因组计划的完成,生命科学研究已进入了后基因组时代.蛋白质组学的研究已成为当今生命科学研究领域中的一个重要分支.该技术可用于寻找和发现区别于正常生理状态下的疾病特异表达蛋白,这有利于疾病发病机理的阐明及疾病的预防、诊断、预后和疗效监测,并可用作新靶点来开发临床治疗药物.国际上,蛋白质组学研究进展十分迅速,不论基础理论还是技术方法,都在不断进步和完善.国内结合多维液相色谱和串联质谱的iTRAQ技术也以其独特的优点得到了比较广泛的应用[10,13,14]用iTRAQ和质谱串联技术识别了能指示经肉毒杆菌C3胞外酶处理的神经元细胞的细胞组成变化的生物标记物.他们一共鉴定出355种不同的蛋白,其中135种可以定量.发现经C3胞外酶处理后,55种蛋白的含量发生了改变,其中44种蛋白的含量丰度有较大提高,仅11种蛋白质含量丰度降低2-HS-糖蛋白、了.这些蛋白包括α-巨噬细胞游走抑制因子、染色体蛋白5、核纤层蛋白A/C、锌指结构.本实验室目前正在进行抗菌肽作用机理的研究,期望利用iTRAQ技术研究抗菌肽体内表达后宿主菌的蛋白含量变化,以阐明其作用机理.目包含各类专业文献、外语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iTRAQ技术及其在蛋白质组学中的应用等内容。 
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