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用于下一代测序数据突变分析的新型基因型估计方法研究
用于下一代测序数据突变分析的新型基因型估计方法研究
A novel genotyping algorithm for SNP detection using next generation sequencing data
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利用下一代测序数据估计基因型对于罕见变异的识别起到重要作用。本课题提出一个统计模型将基因组的结构性变异和测序错误区分开来；该模型通过引入一个隐变量标记基因型,并将测序错误分解为样本效应和位点效应,来刻画不同样本、不同位点上的非参照等位基因频率,从而更好的估计基因型。我们通过ECM 算法实现该模型的参数求解,并根据求解得到的模型参数值代入计算后验概率,从而推断出基因型。我们将该模型与现有的方法分别应用到模拟数据和实际数据的分析中进行比较。通过比较发现,该模型具有更小的基因型错判率。
生物统计；经验贝叶斯；下一代测序数据；基因型估计
Huang Gongyi，
Abstract：
Genotyping the population using next generation sequencing data is essentially important for the rare variant detection. In order to distinguish the genomic structural variation from sequencing error, a statistical model is proposed, which involves the genotype effect through a latent variable to depict the distribution of non-reference allele frequency data among different samples and different genome loci, while decomposing the sequencing error into sample effect and positional effect. An ECM algorithm is implemented to estimate the model parameters, and then the genotypes are inferred based on the posterior probabilities. The performances of our proposed method are investigated via simulations and a real data analysis. Comparing to the existing methods, it is shown that our method can make less genotype-call errors.
Keywords：
B empirical B Next genera Genotyping
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中国科技论文在线：黄巩怡，尤娜.&用于下一代测序数据突变分析的新型基因型估计方法研究[EB/OL].北京：中国科技论文在线&
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镭射影碟在北美中国大陆并不流行，在日本和香港则非常流行，主要用于卡拉OK影碟的生产，其次才是一般电影的影碟。
由于使用模拟方式储存，镭射影碟没有VCD“马赛克”或其他因信号数码化带来的问题，仍有少数爱好者视之为珍藏品。也因为这些特殊技术上的因素，从而使LD没有盗版可言（中国大陆不流行的最大原因），这也是它的收藏价值所在之处。
日本先锋公司日前()宣布，将在最后一批3000台产品制造完成后，正式停产LaserDisc（LD）播放机。由于先锋数十年来一直是LD格式的最大厂商，这一消息也标志着LD格式的正式作古。
在近30年的时间里，先锋LD机的总销量为950万台，而全球各品牌LD机总销量也不过1680万台。由于早已被VCD及其后继产品所取代，先锋表示他们已经很难拿到制造LD机所需的配件，因此不得不停产LD设备。但公司表示，现有客户的售后服务工作将继续进行不受影响。
》是世界上最后一部用LD（Laser disc）发行的电影。什么是镭射
“镭射”是中国台湾和香港地区对英语laser的译音。Laser即light amplification by stimulated emission of radiation(利用受激发射实现光波放大)的首字母缩写，中国大陆译为“激光”。镭射影碟即电影光盘，光盘记录和存储系统使用的是激光技术，它的原理是在小直径的圆盘表面镀以薄金属膜，用激光束在它上面烧出一串微小的坑，用这种方法存储数字数据。磁带上的信息编码后存在主盘上，然后用模压法复制。读信息时用低强度的激光射到表面，并且用光敏二极管“读”反射出来的光信号(有或没有小坑的地方，光敏二极管接收的光量不同)，通过电路转换成数字信息，然后再转换成模拟信息，显示在屏幕上。由此可知，影碟上并没有化学元素镭，因此对人体不会造成伤害。镭射影碟保养
保养有讲究
随着人们生活水平的提高，镭射影碟机已进入了寻常百姓家。一张影碟少则几十元多则数百元，影碟片的日常保养在消费者中越来越受到重视。下面向您介绍保养镭射影碟主要应注意的问题。
1．镭射影碟的信息容量较高，信息轨迹之间的距离很窄，因此镭射影碟应避免在振动或冲击场合中使用，以防止人为或机械振动而引起激光束循迹不良。
2．镭射影碟的表面要保持清洁，避免落入灰尘。影碟存放时，一定要装在封套里。拿取影碟时，要手持影碟的边缘部分，以防止指印汗渍沾污影碟表面，曩响激光束扫描。
3．当镭射影碟从温度较低的地方拿到温度较高的地方播放时，其表面会凝结水汽。在播放前，应先用柔软的干布将水珠轻轻地拭去，否则，将会严重影响放像质量。
4．镭身影碟的片体较薄，强度较低，因此，镭射影碟应尽量布放于平整的地方，不得重压，以防影碟受压变形。镭射影碟叠放时，张数不宜过多，一般以不超过10张为宜。
5．镭射影碟表面有污迹时，不能使用酒精或其它有机溶剂擦试，以免影碟受损。可用柔软的绒布沾水湿润后轻轻擦拭，并注意从影碟中心直接向外擦，而不能顺纹擦拭。
6.对于已变形的镭射影碟，可以进行人工矫正。其方法是将变形的影碟装入一纸套内，夹在两块平整的玻璃板之间，再将4至5公斤重的书籍平整地压在玻璃板上。24小时后影碟即可恢复正常。
（Laser Diode)发出的
是相干光，其方向性比
好很多，大大提高了光源和光纤耦合效率，在半导体激光器中要形成激光，需要具备以下三个基本条件：
1、在有源区里产生足够的粒子数反转分布。
2、存在光学谐振机制，并在有源区里建立起振荡。
3、必要的激励源或泵浦源。LD的功能
LD实现电光转换，优良的
是低域值，低驱动电流，高发光效率，工作温度范围宽。LD的发光原理
外界电流注入LD芯片的有源层，实现粒子反转，当有源层中形成反转分布的电子从导带跃迁到价带与空穴复合释放出光子，这些光子在由两个解理面形成的谐振腔中往复反射传播不断加强而获得光增益，当光增益大于谐振腔的损耗时，便有激光向外射出。激光器实质上就是一个受激发射的光振荡放大器。LD常用参数
1、正向电压（Vf)
当正向驱动电流为一确定值（如Iop=Ith+20mA)时 ，对应的激光二极管的电压值
2、阈值电流（Ith）
激光二极管开始振荡的正向电流
3、输出光功率（Po）
在阈值电流以上所加正向电流达到规定的调制电流时，从激光二极管输出的光功率
4、激光二极管发光效率（η）
没注入输入1毫安的电流所获得的输出光功率（uw）
5、中心波长（λ）
连续50%最大幅度值线段的中心所对应的波长
6、光谱宽度（Δλ）
对于F-P型LD类产品来说，最大均方根宽度定义；对于DFB型LD类产品来说，规定光输出功率下主模中心波长的最大峰值功率跌落-20dB时的最大全宽为光谱宽度。
7、边模抑制比（SMSR)
指在规定的输出光功率和规定的调制时最高光谱峰与次高光谱峰强度之比
8、示踪误差（TE）
指测试条件为恒定的背面光电流，两个不同管壳温度条件下的光纤输出功率的比值LD按结构分类
1、法布里-珀罗（F-P)
2、分布反馈（
3、垂直腔面发射激光器（
4、分布Bragg反射器（DBR)
5、量子阱(QW)
学习障碍/LD
（Learning Disabilities）是20世纪60年代由美国
提出的术语。到目前为止，可查阅到的与学习障碍有关的术语及其定义已达90种以上。美国“全国学习障碍联合会”给学习障碍下的定义：“学习障碍是指在听、说、读、写、推理或数学等方面的获取和运用上表现出显著困难的一群不同性质的学习异常者的通称。”这些异常现象是个人内在的，一般认为指中枢神经系统功能失常。个体在自控行为、社会知觉与交往中的问题可能与学习无能同时存在，但这些问题不在LD范畴之中，同时，LD也可能与其它残障（如精神发育迟滞，情绪紊乱等）或外界不利条件（如文化差异，教育缺失或不良）相伴发生于同一个体，但LD并非后者的直接后果。
长期以来，我国教育工作者是在“差生”、“双差生”、“后进生”、“学业不良”等名义下进行LD的相关研究。很少探讨LD的界定。80年代以来，又出现了“学习困难”、“学习无能”、“学习障碍”等词语，以“学习困难”的出现频率为最高，但这几个概念一直是混淆使用着。另外，一些研究者对学习障碍的界定，时常简化为“差距”或“学习成绩低下”。例如，把智商在正常水平、学习的主要科目成绩不及格或低于平均成绩一个标准差以上的儿童认定为LD儿童，或把因学习差，主要科目成绩不及格，被教师评定为学习能力差的儿童认定为LD儿童。我国学术界对学习障碍还没有一个明确的界定。
学习是大脑的一个重要机能，学习障碍是一种学习技能的发育障碍，这类学生并非呆傻或愚笨，而是从发育的早期阶段起，获得技能的的正常方式受损，主要指在获得和应用听、说、读、写、算能力及推理等方面出现明显困难，这些困难严重妨碍了学习效果。Kirk（1989）将学习障碍儿童分为两大类，即发展性学习障碍和学业性学习障碍。 发展性学习障碍(developmental learning disabilities）是指在儿童正常发展过程中出现的心理、语言功能的某些异常表现，多与大脑信息处理过程的问题有关。这类问题主要表现为： 注意障碍、记忆障碍、（视、听）知觉障碍和感知--运动障碍、认知能力障碍、语言障碍等。学业性学习障碍（academic learning disabilities）是指有显著阻碍阅读、拼写、写作、计算等学习活动的心理障碍。这些障碍往往在入学后由于实际成就水平低于潜在学业能力而表现出来。其主要表现为阅读障碍、拼写障碍、写作障碍和计算障碍等。
当一个学生学习成绩不佳时，如果我们排除了他存在智力落后、情绪困扰或其他环境因素后，往往就要从其大脑信息加工过程以及注意、记忆、语言等方面来找原因。事实上发展性障碍并不总是阻碍着学生的学习能力。人们可以用各种方法来补偿儿童缺陷。而且仅仅在某一个方面存在发展性缺陷并不一定就会导致学习障碍。许多情况下学业性学习障碍往往是由多种发展性学习障碍并存带来的结果。例如当儿童同时存在视知觉和听知觉缺陷时，即使有较高的智力也难以补偿其学习障碍。对于不同类型的学习障碍应制定个别化的教育方案，进行有针对性的训练，才能提高孩子的学习能力。
随着社会的进步，人类生活环境的变化，学习障碍的发生率呈上升趋势。有资料表明：发达国家比发展中国家发生率高，如美国为10－20%左右。我国1982年抽样调查，有学习障碍的学生约占学生人数的5%－10%，小学生多于中学生，男孩多于女孩。
英雄简称　德鲁伊：Syllabear，LD，
在那次剧烈的冲突中，Syllabear是他的部族中仅存的一个。当感觉到居住的地方面临着毁灭的时候，他的族人们将他们的孩子变成一头熊，并放至山林。Syllabear渐渐成长，并且变得和森林里那些栖息在他家的熊一样强壮，凶猛。他能通过德鲁依的力量进入一个狂热的状态，甚至能呼唤强大的熊伙伴来援助他。被
Furion唤醒他的精灵血统后，Syllabear重新变回精灵形态，并将他那野性的灵魂带到战场中去。成长系数
初始射程 (Base Range): 550 | 初始攻击间隔 (Base Attack Time): 1.7
初始移动速度 (Base Move Speed): 305 | 初始防御 (Base Armor): 3.4
基本属性 (Primary Attribute): 敏捷 / Agility | 初始攻击力 (Base Damage): 46 - 50
初始力量值 (Base Strength): 17 | 初始敏捷值 (Base Agility): 24 | 初始智力值 (Base Intelligence): 13
力量增长系数 (Strength Growth): 2.10 | 敏捷增长系数 (Agility Growth): 2.70 | 智力增长系数 (Intelligence Growth): 1.40
远程弹道：900英雄技能
召唤熊灵 (Summon Spirit Bear) [B]
召唤一个熊灵伙伴为自己作战，消耗75点的魔法。能携带和使用物品。当它离你925码距离之后，将无法做出攻击。
一级 - 召唤一个熊灵伙伴，拥有1400点的生命。它会随你死去而死去，当它单独死去时，你将失去75点的生命。
冷却时间180秒。
二级 - 召唤一个熊灵伙伴，拥有1800点的生命。增加回归能力，可以随时回到你的身边。它会随你死去而死去，当它单独死去时，你将失去120点的生命。
冷却时间160秒
三级 - 召唤一个熊灵伙伴，拥有2300点的生命。它会随你死去而死去，当它单独死去时，你将失去175点的生命。熊灵在攻击时有20%的几率缠绕目标，被缠绕的目标受到60点/秒的伤害，不能移动和攻击，持续3秒。它有回归能力，可以随时回到你的身边。
冷却时间140秒。
四级 - 召唤一个熊灵伙伴，拥有2700点的生命。提升33%的
。它会随你死去而死去，当它单独死去时，你将失去235点的生命。熊灵在攻击时有20%的几率缠绕目标，被缠绕的目标受到60点/秒的伤害，不能移动和攻击，持续3秒。它有回归能力，可以随时回到你的身边；同时有粉碎击能力，对建筑造成160%的伤害。
冷却时间120秒。
&关于缠绕的注意事项：
可以阻挡缠绕。而天神下凡和缠绕间有微妙的关系，这两个状态可以互相作用于对方。比如食尸鬼狂暴以后，你仍然可以在他身上触发缠绕效果；如果他是被缠绕以后开狂暴，则缠绕状态立刻解除。简而言之，缠绕可以作用于天神下凡的单位！
&德鲁伊的招牌技能，不管你打算如何培养你的英雄，都应该优先把这个技能升满。
的缠绕是整个游戏里对单个目标最棒的限制技之一，只要给
配备假腿就可以保证这一技能可以经常被触发。要注意虽然宠物拥有超多生命值，但还是会被人打成红血，注意它的hp，并及时送它回泉水边休养。宠物死掉是很伤的一件事，不光送给对手一大笔钱和经验，还会让德鲁伊自己损失生命值。
狂猛 (Rabid) [R]
Syllabear可以通过战斗的怒意暂时提升他和他的熊灵伙伴的攻击速度和移动速度。
持续10秒。消耗50点的魔法，冷却时间30秒。
一级 - 提升Syllabear和他的熊灵伙伴10%的攻击速度和5%的移动速度。
持续10秒。
二级 - 提升Syllabear和他的熊灵伙伴20%的攻击速度和10%的移动速度。
持续10秒。
三级 - 提升Syllabear和他的熊灵伙伴30%的攻击速度和15%的移动速度。
持续10秒。
四级 - 提升Syllabear和他的熊灵伙伴40%的攻击速度和20%的移动速度。
持续10秒。
&一个非常廉价值得多多使用的技能，而且能够提供相当高的攻击和移动加成。这个技能不管是追击还是逃跑都是十分实用的，所以我有时候会在早期就升级一点以应付各种情况。
协同 (Synergy) [Y]
每一等级提升德鲁伊和他的熊灵伙伴的默契：
熊灵伙伴Spirit Bear - 增加熊灵10点的攻击力和10的移动速度。
狂猛Rabid - 增加10秒的持续时间。
变形术True Form - 增加
时的生命值。
一级 - 提升德鲁伊和他的熊灵伙伴的默契：增加熊灵10点的攻击力和10的移动速度；增加狂猛10秒的持续时间；
得到额外的100点的生命。
二级 - 提升德鲁伊和他的熊灵伙伴的默契：增加熊灵20点的攻击力和20的移动速度；增加狂猛20秒的持续时间；巨熊形态得到额外的200点的生命。
三级 - 提升德鲁伊和他的熊灵伙伴的默契：增加熊灵30点的攻击力和30的移动速度；增加狂猛30秒的持续时间；巨熊形态得到额外的300点的生命。
四级 - 提升德鲁伊和他的熊灵伙伴的默契：增加熊灵40点的攻击力和40的移动速度；增加狂猛40秒的持续时间；巨熊形态得到额外的400点的生命。
&不管你选择什么成长路线，这个技能都非常，非常的有用。这个技能对德鲁伊最重要的提高就是延长狂猛的持续时间，这样就可以24乘7的使用本就已经很强的狂猛技能了。
变形术 (True Form) [F]
Syllabear可以变形为一只棕色大熊，熊是近身攻击单位。他能够自由切换熊和人类的形态。
消耗25点的魔法。熊形态时移动速度降低35，形态转换时间为2秒。
一级 - Syllabear变身为熊，成为近身攻击单位，增加250点的生命，增加4点护甲。
二级 - Syllabear变身为熊，成为近身攻击单位，增加400点的生命，增加6点护甲。熊具有战斗嚎叫（Battel Cry）的能力。
三级 - Syllabear变身为熊，成为近身攻击单位，增加600点的生命。增加8点护甲。熊具有战斗嚎叫（Battel Cry）的能力。
战斗嚎叫 [C]
德鲁伊可以变形为一只棕色大熊后拥有技能嚎叫。
冷却时间：30秒
魔法消耗：50点
持续时间：8秒
一级 - 提升20点攻击，2点护甲。
二级 - 提升40点攻击，4点护甲。
三级 - 提升60点攻击，6点护甲。
注意当你使用变形时，你将按照变形前人形态所剩hp的百分比来获得hp加成。换句话说，变形以后并非裸加1000hp；如果你被人打得快要死了，就算变成熊也一样是红血。
模具钢材/LD
是一种高强韧性冷作模具钢，上海材料研究所研制。该钢在保持较高韧性的情况下，其抗压强度、抗弯强度、耐磨性较65Nb优，是LD 系列中应用最广的钢种。该钢种主要用于高冲击载荷下要求强韧性的冷冲模和冷镦模，如汽车板簧的冲孔冲头、标准件与钢球的冷镦模等，也用于压印模和拉深凸模。
冶金词汇/LD
一种炼钢方法
瑞典人罗伯特&杜勒首先进行了氧气顶吹转炉炼钢的试验，并获得了成功。1952年奥地利的林茨城(Linz)和多纳维兹城(Donawitz)先后建成了30吨的氧气顶吹转炉车间并投入生产，所以此法也称为LD法。美国称为BOF法（Basic Oxygen Furnace）或BOP法。
利达产品/LD
利达LiDa系列产品的型号简称：LD
常用于表示此类产品的参数及配置，如LD-533B云终端、LD-680A电脑共享器等。
学习设计/LD
学习设计规范应用在e-Learning领域的实际过程中，是设计一个课程框架，以支持课程的多样性及课程创新，并同时促进e-learning学习材料的可交换与互操作；强调以学习活动为中心，利用教育建模语言描述各种不同的教学法，比如协作学习、混合式学习、基于问题的学习等。1.1 概览
本文档描述的是学习设计信息模型。该信息模型将荷兰开放大学提交给学习设计工作组（Learning Design working group, LDWG）的教育建模语言（Educational Modelling Language, EML）与现有的IMS规范，特别是内容包装规范[LD2]进行了整合、扩展，同时也综合考虑了元数据规范[LD3]及简单编列规范[LD4]。
学习设计工作组的主要任务，是“设计一个课程框架，以支持课程的多样性及课程创新，并同时促进e-learning学习材料的可交换与互操作”。
荷兰开放大学在开发EML这一简练的“元语言”之前，对课程方法的多样性进行了广泛而细致的调查与分析，以便通过EML全面地反映这种多样性。不管针对的是什么学科，在实践中，每一个学习设计可归结为：对学习者及其他学习参与者以某一顺序开展的各种活动的描述。每一种活动都是特定对象和用以执行活动的服务（可称为“环境”）的集合。为了支持这种个性化的学习设计，需要对学习者特征、学习环境条件、通告等要素进行描述。使用这种元语言描述的设计适用于单个学习者，也适用于多个学习者；所采用的学习方法可以是行为主义的、认知主义的、建构主义的、或任何其他主义的；学习者可以是独立学习的，或是协作学习的。荷兰开放大学的研究表明，上述这些要素在元语言方法（Method）中都能够描述，方法（Method）包含角色、活动结构、环境、以及许多其他相关概念（在[LD5]详细阐述）。
这一元语言的优势在于，它不是试图对每一种方法利用术语进行描述，而是用一套简洁的词汇，对每一种方法所涉及的学习者及教学人员进行描述。前者所涉及的词汇必然远远多于后者。元语言的另一优势在于，不同的教学方法都可以通过统一的“学习设计”，为不同的学习者设计不同的教学方法。
元语言也支持混合的教学传递模式（即混合学习），这使得传统的教学方法，例如面对面教学、阅读、实验、实地参观等都能够描述为学习活动，并能够与ICT环境的学习活动进行结合。
在对教学方法加以描述的基础上，该语言不仅能够用来对教学方法进行说明，也能够用来更便利地开发新的教学方法。本文档的后面对该语言进行了描述，包括词汇、信息结构语法、语义，以阐明其设计规范。1.2 实现和一致性的三个层次
学习设计规范定义了实现和一致性的三个层次。本文档分别对此作了介绍。每一层应用对应一个独立的XML文档。
第一层学习设计（学习设计A级）包含了描述多样教学方法的所有核心词汇。第二层和第三层是在此基础上分别增加了三组概念及其性能，以便对更加复杂的行为加以描述。
第二层学习设计（学习设计B层）是在A级基础上增加了属性和条件，以便在学习者学习档案的基础上实现更加个别化、精细化的学习过程和学习交互。该层学习设计可以用来引导学习活动、记录学习成果。将属性与条件分离也可使之用于学习设计规范的其他场合，特别是可以用来对IMS的简单编列规范加以补充。
第三层学习设计（学习设计C层）在B层的基础上增加了通告，这对于整个规范来说虽然是很细微的补充，但却具有非常重要的意义，特别是对于规范的应用具有潜在的指导作用。
因此，此规范所采用的方法，并不是定义一个单一而巨大的规则库及其选项，而是定义一个完整的、尽可能简洁的核心（模型），在此基础上定义扩展的属性及行为，以便反映复杂的学习活动。
我们希望遵照规范的应用既严格又有一定的灵活性：A级是很容易达到的，而灵活性就在于，是否或者何时应用此规范的更高层次。
任何一层的应用系统，都希望是遵照规范的。相对于学习设计，遵照此规范实施的实例文档，不需要实现规范中的每一个要素，因此在内容与支持系统之间，对规范的遵照是有差别的。可选要素适用于文档实例；而系统需要在某一层次上严格遵照规范的每一个规定，这样才能在该层次上运行所有实例，不管该实例的选项包括哪些。利用附加的XML解析器对遵照这一规范的学习设计实例进行解析才能使之生效，但是需要指出希望运行系统支持哪一层次的应用，这样系统才能确定是否能够运行特定层次的学习设计实例，因为并不是所有系统对三个层次都提供支持。1.3 学习设计与其他规范
学习设计规范可以看作现有的许多规范的一个综合层。IMS的学习设计规范综合利用了以下规范，或者是对以下规范进行了扩展：
IMS内容包装规范。IMS学习设计更适合与IMS内容包装规范相结合，以创造所谓“学习单元”，这将在后面的[LD2]部分进行详细讨论。
IMS简单编列规范。IMS简单编列规范可以用来：（1）在某一学习对象中对资源进行编列，（2）在某一学习环境中对学习对象进行编列。当简单编列与内容包装结合，其工作原理与上述过程类似。简单编列的要素能够映射为学习对象和学习环境的要素，这种映射关系将在IMS绑定中详细阐述[LD4]。
IMS/LOM元数据规范。在IMS学习设计中，元数据占位符呈现多种不同结构。IMS/LOM的元数据规范可以包括进来。
IMS提问与测试互操作规范（QTI）。IMS的QTI可以通过两种方式加以整合：将QTI的要素作为学习环境/学习对象要素的独立组成部分，这样测试可以与学习活动连接起来，以完成整个学习活动过程。另外，也可以将其整合到IMS内容包装规范中，作为一种特殊的资源[LD6]。
IMS可重用能力定义或教育目标规范（RDCEO）。根据这一规范，可以将学习目标、学习条件和学习资源之间建立起关联。另外IMS内容包装规范中的“条目”项，也有助于描述学习目标[LD7]。
IMS学习者信息包装规范。IMS学习设计的属性可以完全与IMS的LIP [LD8]映射。
IMS 事务（Enterprise）可以用来在实现一个学习设计的时候对学习者进行映射，或支持教学人员角色。
在IMS学习设计规范中，也可以将SCORM内容包括进去。这可能需要对其类型进行设置，并且需要运行环境支持SCORM内容的传递与管理[LD10]。
将规范加以结合的标准做法是通过XML的命名空间机制。所有的IMS规范都有各自的命名空间。1.4 范围与语境
本文档是IMS的学习设计规范。因此该文档也是以下文档的基础：
l IMS学习设计XML绑定（级别A、B、C）；
l IMS学习设计实践范例与实施指南
三份文档合在一起，构成了IMS学习设计规范。
而信息模型描述的是学习设计的模型，由以下三个主要部分组成：
一个概念模型：包括描述概念的词汇表、概念之间的功能关系、与IMS内容包装之间的关联。概念模型是从全局的角度（层次C）进行描述的。
一个信息模型：分别从三个层次描述IMS学习设计的要素。同时也对不同层次的特定概念模型进行了描述。
一个行为模型：描述了传递系统必须实现的运行时行为。1.5 术语表
EML：教育建模语言，Educational Modelling Language
IMSCP：IMS 内容包装标准，IMS Content Packaging Specification
IMSMD：IMS/LOM 元数据标准，IMS/LOM Meta-Data Specification
IMSQTI：IMS 的问题与测试互操作标准，IMS Question and Test Interoperability Specification
LOM：学习对象元数据，Learning Object Metadata (IEEE
PCDATA：字符数据，Character Data
UML：统一建模语言，Unified Modeling Language
URI：统一资源标识符，Universal Resource Identifier
W3C：World Wide Web Consortium
XML：扩展标记语言，Extensible Mark-up Language
LD工业集团是专业生产润滑系统的国际性企业，其中国生产基地位于河北。成立近十年来，在中国市场占有了不可取代的地位。
LD集团集生产研发、推广销售、安装调试及售后服务于一体。拥有一支专业的技术研发及销售推广团队。
其产品包括双线智能润滑系统、双线集中润滑系统、移动式电动补油泵站、移动式电动加油泵站、双线分配器、递进式分配器、数显式末端压力开关等，产品主要应用于钢铁冶金、有色金属、石油化工、机械制造、能源电力、交通运输等多个行业。
连锁不平衡(Linkage disequilibrium)分析在连锁不平衡程度的评估，复杂疾病精细定位以及研究人类的历史和迁移中得到了越来越广泛的应用。连锁不平衡又称等位基因关联（allelic association），其原理其实很简单。假定两个紧密连锁的位点1，2，各有两个等位型（A，a；B，b），那么在同一条染色体上将有四种可能的组合方式：A—B，A—b，a—B，和a—b。假定等位型A的频率为Pa，B的频率为Pb，那么如果不存在连锁不平衡（如组成单倍型的等位型间相互独立，随机组合）单倍型A—B的频率就应为PaPb。而如果A与B是相关联的，单倍型A—B的频率则应为PaPb+D，D是表示两位点间LD程度的值。如果位点2上的等位型B与疾病易患性有关，那么将会观察到等位型A的频率在病人群体中高于对照群体。换句话说，等位型A与该疾病性状相关。事实上，可以检测遍布基因组中的大量遗传标记位点，或者候选基因附近的遗传标记来寻找到因为与致病位点距离足够近而表现出与疾病相关的位点，这就是等位基因关联分析或连锁不平衡定位基因的基本思想。
等位基因(alleles)：同一位点上可能出现的基因，例如ABO血型基因
基因型(genotype)：同一位点上两个等位基因的组合。
基因频率(allele frequency)：人群中一个等位基因占该位点全部基因的比例。
基因型频率(allele frequency)：人群中特定基因型占该位点全部基因型的比例。
如同一位点上两个等位基因分别为A和a,则A的频率（p）和a的频率(q)的之和为1。即p +q=1A基因的频率为p，a基因的频率为q。该位点的基因型有三种，分别是AA，aa和A a。基因型为AA的频率=p&p基因型为aa的频率=q&q基因型为Aa的频率=2&p&q
单倍型也叫单体型,单体型(haplotype)是指一条染色体上紧密相连的两个或两个以上基因座一组等位基因的基因型，通常作为一个单位遗传不同基因座位的各等位基因在人群中以一定的频率出现。在某一群体中，不同座位上某两个等位基因出现在同一条单元型上的频率与预期的随机频率之间存在明显差异的现象，称连锁不平衡 (Linkage disequilibrium) 。由于 HLA 不同基因座位的某些等位基因经常连锁在一起遗传，而连锁的基因并非完全随机地组成单元型，有些基因总是较多地在一起出现，致使某些单元型在群体中呈现较高的频率，从而引起连锁不平衡。
假设在同一染色体上有临近的两个双等位基因位点A和B，4个等位基因的频率分别为PA、Pa、PB和Pb。如果两个位点之间完全独立分离，那么单倍型AB的频率的期望值为PA*PB，而如果观察到的实际频率为PAB ，那么两个位点之间的连锁不平衡程度可以表达为如下式子：
D=PAB-PA*PB
虽然D能够很好的表达LD的基本含义，但是由于其严格依赖于等位基因频率（allele frequency），故不适合应用于表述实际的LD强度尤其是进行不同研究的LD值的相互比较。
几个常用于度量LD的符号中，最重要的是D’和r2，两者都是基于D，各有各的特点及用途。他们的数学表述如下式子：
D’和r2值为零时，连锁完全平衡；
D’和r2值为1时，连锁完全不平衡
D’=D/DMax Dmax=min(PAPb，PaPB)
D’=D/Dmax 对于A、B两个位点，AI、BI两个等位基因连锁出现的频率为PII，AI、BI、A2、B2的频率分别为p 1,q 1,p2,q2； 其中D=PII-pIqI，Dmax=min(p1q2，p2qI)
r2 =D/ PA*PB*Pa*Pb
当两个位点组成的可能4种单倍型只出现其中3种时，D’=1，即两个位点处于“完全连锁不平衡（complete LD）”。而D’&1的时候，D’的数值究竟表征了多大程度的连锁不平衡，是很难做出准确判断的。另外，D’一个的重要特点是严格依赖于样品量的大小。如果样品量太小，D’值的实际含义很容易被“夸大”，尤其某个位点的其中一个等位基因的频率很低的时候。因此，较高D’值的背后，实际上可能是连锁不平衡程度很低的两个位点。统计学上较高D’值仅仅暗示了重组发生率较低。而普通程度的D’&1不适合于度量LD，以及比较不同研究之间的LD程度。因此，使用D’作为LD程度的度量，需要做谨慎的评估和判断。如果用P值来描述LD，更须谨慎。因为P值严格依赖于样品量大小，故也不宜用于不同研究之间的比较。
其他缩写/LD
ld -- GNU Linker
ld--GNU连接器。
ld是GNU工具链中的一个软件，主要用于将obj文件连接成
。同时你能使用自己的
来控制ld的行为，这是你可以通过-T选项选择你的脚本而不是默认的。医致死剂(药)量
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long distance违约赔偿金
Liquidated Damages
LD--在C语言程序设计中，LD表示“传送”的意思。
路面弯沉值
参考 《公路沥青路面设计规范》
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