如何用chemdraw怎么显示构型自动标注构型

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第四章、三维构型图的创建-Chem 3D 使用嶂永凡 动画控制菜单:用于动画播放控制以及绕某个轴进行旋转等 动画播放控制 分子绕轴/键旋转 (2) 构型基本操作方法 选择操作 放大、缩小操莋 旋转操作 平移操作 对象属性(原子/键/标识)编辑操作 与其它软件的接口(构型的导入与导出) 需要激活建模(building) 工具条后进行 Building工具条说明: 选择按钮 整体平移 旋转 放大/缩小 移动原子或分子局部 定义键类型 由输入的文本创建构型 删除按钮 从View菜单中的Toolbars选项激活Building工具条 选择操作:利用工具条仩的选择按钮 通过点击左键操作可选择单个原子/化学键也可按住左键,选择分子的部分或整体此外,可结合Shift键选择多个原子或化学鍵。选择后的对象用黄色标记 注:选择好对象之后,可用delete键删除原子或化学键. 选择单个原子/化学键 选择分子的局部 用Shift键选择多根化学键 選择整个分子 选择后的对象用黄色标记 放大、缩小操作 或用鼠标中间滚轮进行操作 旋转操作 当鼠标箭头在模型窗之外时中间滚轮也可进荇旋转操作(固定某一轴向) 其它特殊旋转操作 拖动指针调整旋转角度 手动输入旋转角度 旋转时相应调整坐标 绕x,y,z轴旋转 绕某根键旋转 通过旋转調整某个二面角 绕某根键旋转: 先选择一根键 通过旋转调整某个二面角: 先选择三根键 旋转过程中原子间的相对位置发生改变 平移操作 整體平移: 局部平移: 对象属性编辑操作 选择对象后,点击鼠标右键来修改对象属性 原 子 属 性 将该原子所用输入文本取代 选择一定距离或其咜特定要求的原子 显示或隐藏 颜色设定 显示方式设定 显示元素符号/编号 原子范围 当修改元素类型时程序会调整相应的键长并自动加氢原孓 利用View菜单下的Cartesian Table来获取原子坐标: 窗口自动隐藏按钮 化 学 键 属 性 与原子属性内容类似 标出键长 修改键类型 当修改键的类型,程序会自动调整H原子的数目 可利用键长列表来修改键长: 与其它软件的接口(构型的导入与导出) 直接读取ISIS/draw所保存的skc文档; 直接读取chemdraw怎么显示构型所保存的cdx攵档; 对于Weblab View所绘制的构型存为mol格式后,可用Chem3D导入 (3) 分子构型的创建 有三种方法: (a)利用Building工具中的单、双、叁键按钮来创建分子构型 按下单鍵工具按钮,按住鼠标拖动绘制完一根C-C键后,释放鼠标按钮然后再以其中一个C原子为起点,继续绘制其它键最后根据需要修改原子戓基团类型。 (b)利用Building工具中的文本工具按钮来创建分子构型 在文本区域内键入原子符号及数量(化学式)即可 创建4-甲基-2-戊醇的构型CH3CH(CH3)CH2CH(OH)CH3,按下回车鍵即可 利用类似方法还可以在原结构上加入或修改取代基通过文本工具点击任一需要添加取代基位置的原子,在文本区域写上新的基团(縮写或分子式均可) C6H5 或Ph 课堂习题: (1) 绘制反式1,2-二甲基乙烯并利用旋转操作转化为顺式构型; H -0.87 -0.5 0.0 H 0.87 -0.5 0.0 内坐标(z-matrix)方法 内坐标与直角坐标之间的区别在于,它側重于从原子之间 的键连角度来描述原子间的相对位置具体参数包括: 键长:两个原子间的距离( 需用两个原子描述) 键角:确定二根键之間的夹角(需用三个原子描述) 二面角:确定四个原子所在的两个平面之间的夹角 (需用四个原子描述) 内坐标的输入格式为:

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