interpro软件中ipr后面的数字ipr是什么意思思

Interproscan,通过蛋白质结构域和功能位点数據库预测蛋白质功能是EBI开发的一个集成了蛋白质家族、结构域和功能位点的非冗余数据库。Interproscan整合了一些使用最普及的一些数据库并应鼡于功能未知的蛋白进行Interpro注释和GO注释。
以下介绍3中interpro注释的方法:

打开InterProScan的官网地址:将序列粘贴到输入框中进行Interpro注释。

优点:使用网页版方便快捷;不消耗本地计算资源。
缺点:输入必须为蛋白质序列;一次只能比对条蛋白质序列
优点:不消耗本地计算资源;可以自己編写脚本来大批量比对本地的protein序列到EBI的
缺点:比对结果为xml格式,普通科研人员玩不来




(解压后进去有个data目录后续panther数據解压放进去,配置文件默认路径如果放其他地方,设置一下)

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