现代支付系统直接参与者清算账戶是指经批准的现代支付系统直接参与者()直接参与者和特许参与者在人民银行各级分支机构开设的用于办理支付业务资金清算的存款账户
对直接参与者而言，现代支付系统直接参与者清算账户即其存款准备金账户间接参与者不存在清算账户，间业务通过其所属上级荇直接参与者(清算行)进行处理清算账户通过清算账户管理系统实现支付业务资金清算的处理，并通过该系统管理清算账户清算账户在設置和使用上采用“物理上集中摆放，上分散管理”的方式进行即现代支付系统直接参与者直接参与者在人民银行当地分支机构开设存款准备金账户，由中央银行会H-核算系统(ABS系统)办理业务并进行管理而物理上集中在国家处理中心(NPC)存储，并由国家处理中心进行
清算账戶业务处理只能在日间进行。清算账户业务核算严格在运行时间即日间范围之内在此期间，清算账户之间以及清算账户与非清算账户の间发生的转账业务，凡涉及清算账户借、贷记业务均发送至NPC进行记账处理大额现代支付系统直接参与者业务截止进入日终后，NPC将核对報文下发至各ABS系统对清算账户进行业务核对，系统随即进入次日营业准备状态
现代支付系统直接参与者设置了日间透支和自动质押融资机制，禁止清算账户隔夜透支是指在现代支付系统直接参与者清算账户日间不足时，通过自动质押融资系统向人民银行质押债券融入资金弥补头寸待归还后质押债券自动解押。是指成员行通过小额现代支付系统直接参与者质押业务系统向人民银行质押债券获得並将该质押额度用作净借记限额分配给本身及其所属分支机构，用于小额轧差净额资金清算担保的自动质押融资机制和小额现代支付系統直接参与者质押业务机制，可以大大增强银行机构有利于提高现代支付系统直接参与者的。
对日间结束清算账户余额不足排队等待的业务处理现代支付系统直接参与者设置了“清算窗口”功能。当业务截止存在排队等待清算的业务时现代支付系统直接参与者自動进入“清算窗口”状态，等待清算账户补足头寸在“清算窗口”规定的时间内仍未筹足资金的，系统会自动退回相应的排队业务若屬轧差净额、轧差净额、小额批量轧差净额等排队业务，则由当地人行对付款清算行提供高额罚息贷款作为最终解决途径补足清算账户頭寸。
