原标题:四步教你快速读懂质粒圖谱
质粒图谱为质粒DNA序列的物理图谱提供了包括质粒的大小、筛选标记、克隆位点、转录及翻译元件等信息,为我们选择质粒、了解质粒特点及应用提供了重要依据
各种英文字母有什么含义?
哪些信息又是我们有必要了解的呢
今天教你四步,快速掌握质粒图谱
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看懂质粒图谱的4个要点↓↓
- 复制起点它控制着质粒的复制,并决定了质粒的宿主和拷贝数
- 筛选标记,了解篩选标记类型方便后续确定筛选重组质粒载体的方法。
- 多克隆位点既外源基因的插入位点。
- 其他元件如转录调控元件、翻译表达元件和蛋白标签等。
第1步 了解质粒图谱中的复制起点
图谱中的ori表示质粒的复制起点质粒的复制起点决定了质粒的宿主及质粒的拷贝数相关,它是质粒中的一段特定序列富含AT和重复序列。
- 图谱上只有一个ori表示质粒是原核克隆及表达质粒
- 图谱上有两个ori,则表示该质粒是穿梭質粒既可以在原核也可以在真核中复制
第2步 了解质粒图谱中的筛选标记
图谱中的AmpR、KanaR等表示质粒载体中的筛选标签,多为抗生素抗性基因方便后续通过抗生素筛选阳性克隆。特点是单词最后会以大写R或上标r结束
- 只在一种宿主中复制的质粒仅具有一种抗性筛选标记,如原核克隆载体和原核表达载体
- 能够在两种类型宿主中复制和表达的载体会具有两种筛选标记如穿梭质粒
第3步 了解质粒图谱中的多克隆位点
圖谱中的MCS或者许多内切酶排排坐的部分,就是质粒的多克隆位点多克隆位点为一系列限制性内切酶酶切位点,是外源DNA的插入位点一般鈳通过酶切/连接的方式将外源DNA插入质粒。
- 位于转录启动和转录终止信号之间
- 所包含的限制性内切酶位点数量和组成因载体不同会有所差异
- 其中的酶切位点在质粒中为单一的酶切位点
- 使用时需注意质粒载体与外源DNA酶切位点的兼容性问题
第4步 看看质粒图谱中还有哪些有用的信息
質粒载体中除复制起始位点、筛选标记、多克隆位点外还具有其他一些表达或调控元件,如转录调控元件、翻译调控元件和融合表达标簽蛋白等
- 荧光蛋白表达标签:GFP,mCherry等
到了这里质粒图谱的修炼已基本完成了~~
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